В 1920 году Я.Лагодюка отправили на инженерные курсы. Однако он был вынужден прервать учёбу, поскольку вместе с бригадой курсантов участвовал в ликвидации группировки Махно. С 1921 по 1924 год Я.Лагодюк был слушателем в Высшей военной школе связи в Москве. После окончания высшей школы его командировали вместе с ротой связи, позже он был назначен помощником командира войск, начальником дивизии связи. В 1926 году Я.Лагодюк поступил в Ленинградский электротехнический институт. Через три года его перевели в Военно-техническую академию. Через год после окончания академии Я.Лагодюка назначили помощником начальника Киевских войск связи.

В 1933 году Я.Лагодюк занял пост помощника начальника войск связи в Дальновосточной армии, а с началом войны – начальника войск связи в Карелии. В 1942 году Я.Лагодюку был присвоен титул генерал-майора войск связи. В марте 1944 года генерал-майор был назначен заместителем начальника в штабе связи 1–го Прибалтийского фронта. Через несколько месяцев Я.Лагодюк стал начальником 4-й ударной армии.

Всегда спокойный и бесстрашный, генерал не любил сидеть в штабе. Его часто можно было встретить на передовых позициях, он ездил по дивизиям и проверял готовность связи. Так было и 27 июля 1944 года. Перед самым началом освобождения Даугавпилса генерал Я.Лагодюк решил объехать передовую. В этот момент около Науенского парка машина Я.Лагодюка была обстреляна. Генерал и его адъютант скончались на месте.

Я.Лагодюк был похоронен в парке Ленинского комсомола в Даугавпилсе (парк Дубровина). Его могила стала первой в парке.

В подготовке статьи использованы материалы из архива Даугавпилсского краеведческого и художественного музея, научного архива Даугавпилсской инспекции по охране памятников культуры, Даугавпилсского зонального государственного архива, а также материалы газеты «Красное знамя».